作者根據自己對大自然物種的觀察，結合他人的觀點，以及家養物種的變化規律等，對物種的起源、進化、分布等問題進行推論，得出著名的「自然選擇學說」。接着，他又嘗試對變異來源進行推論，並結合實驗結果等，對那些向他提出質疑的人進行解釋與回答。*后，他又從地質學證據入手，嘗試揭開物種分布之謎，更進一步地論證了自己的學說。