打擊犯罪!!兩大犯罪集團，火岩隊和水艦隊開始狼狽為奸！
另外，再度重逢的路比和莎菲雅關係卻逐漸惡化…。
在一陣錯綜複雜之中…兩隻超古代神奇寶貝終於覺醒了！